逆轉錄-聚合酶鏈式反應技術（RT-PCR）用于檢測EWS 和AFT1兩種基因是一種很有效的方法，而這兩種基因是透明細胞肉瘤的分子標志物。Bergonie研究所的Jean-Michel Coindre博士在9月份《腫瘤雜志》上發表文章稱，盡管通常情況下診斷透明細胞肉瘤并不困難，但是當這種疾病發生移位時使用RT-PCR進行診斷具有不可替代的優勢，另外用常規方法診斷透明細胞肉瘤還可能被誤診為黑色素瘤。

     為了研究RT-PCR在診斷透明細胞肉瘤的實用性，研究人員對36名透明細胞肉瘤患者的石蠟包埋組織標本，9名疑似患者的標本及14名黑色素瘤確診的患者的標本進行了研究。在黑色素瘤標本中沒有監測到任何EWS-ATF1的轉錄，然而，在9名疑似透明細胞肉瘤患者中有7名患者可以監測到EWS-ATF1的轉錄。研究人員表示雖然結合臨床資料通過蘇木精、伊紅染色及免疫組織化學等方法可以診斷大多數透明細胞肉瘤，但是，RT-PCR對于診斷移位透明細胞肉瘤及鑒別診斷黑色素瘤具有其獨特優勢。