中國科學院上海藥物研究所沈旭研究員領導的課題組與蔣華良研究員領導的課題組合作，最近成功解析了抗幽門螺桿菌（Hp）藥物設計的重要靶點――二氨基庚二酸脫羧酶（DAPDC）晶體，其研究成果發表在美國《生物化學雜志》上。 　　

     幽門螺桿菌是消化道潰瘍、胃腺癌以及胃淋巴癌的主要誘因，其有效的藥物治療是消化病學研究的一個熱點。然而，抗生素的濫用等使得幽門螺桿菌對現有療法的耐藥性越來越高，發現新型抗菌藥物迫在眉睫。針對細菌獨有代謝途徑中的關鍵酶設計與開發藥物已成為抗菌藥物研究的一條重要途徑，DAPDC就是這樣一個理想的靶標。 　　DAPDC屬于IV型磷酸吡哆醛（PLP）依賴性酶，它催化二氨基庚二酸脫羧形成-賴氨酸，是細菌賴氨酸合成途徑中的最后一步。研究人員針對幽門螺桿菌的DAPDCL進行了結構功能研究，首次獲得了HpDAPDC與PLP及反應產物L-lysine的復合物晶體，并解析了其結構。結果發現這是DAPDC酶家族的第一個反應中間態結構，即反應產物L-賴氨酸與輔酶PLP共價結合形成了外源醛亞胺的構象，為了解DADPC的底物結合情況及催化機理提供了迄今為止最詳細深入的結構信息，也為針對DAPDC設計特異性抑制劑提供了寶貴的線索。 　　

    另外，研究還發現，與其他DAPDC的結構不同，HpDAPDC的活性口袋被一蓋子完全封閉。研究人員通過比較推測認為，此蓋子在酶催化的反應過程中會發生“打開”-“關閉”的構象變化，以穩定催化中間態及釋放產物，結果通過相應的突變體酶催化活性測定與結構解析給予了有力的證明。這一發現強調了誘導契合的催化方式在IV型PLP酶催化機理中的重要地位，對設計特異性HpDAPDC抑制劑具有提示意義。