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鑒定微生物的新技術

【?2006-04-03 發布?】 美迪醫訊
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使用一種新高通量技術能夠在未知微生物群落中鑒定微生物的種類。

 

能識別特定序列的遺傳密碼的酶可以將微生物的基因組切成數段小的片段,這些片段既包括所有微生物具有的共有基因,也含有豐富的決定生物物種特征的獨一無二的遺傳信息。

 

通過培養細菌來進行鑒別種類時間長而且并非總是準確。基因組的全序列測定是密集型勞動且費用大。美國能源部Brookhaven國家實驗室 (Upton, NY, USA; www.bnl.com) 的科學家已開發出一種新技術,他們稱之為基因組單點標記示蹤法。比如說,科學家在基因開始端的上游區制造一段16字母的遺傳密碼標記,而這個基因是一段編碼一種特定酶的高度保守的單點基因序列。通過對這些標記的序列測定及已知菌種基因組數據的對照,科學家發現這段16個字母區包含充分的獨特遺傳信息來鑒別群落中的所有種屬層次及大部分的種類。

 

Daniel (Niels) van der Lelie作為該研究的領銜作者在20063月期的Applied Environmental Microbiology雜志上談到,微生物群落相當多變而復雜,每一毫升水里就有幾百種和每

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