當前，新型農村合作醫療正在迅速發展。從江西的情況來看，省級、設區市成立了新農合領導小組，試點縣（市、區）、鄉（鎮）成立了新農合管理委員會，分別下設的辦公室為經辦機構。但目前大多數經辦機構的工作人員是由衛生部門臨時借用或抽調的。由于沒有正式編制，人員的工資、福利得不到解決，造成人心不穩定，工作積極性不高，加上人員經常更換，人員素質參差不齊，培訓成本加大，工作連續性不強。筆者在九江市調研時了解到，該市15個縣（市、區），總人口470萬，其中農業人口350萬。全市參加城鎮職工醫療保險的只有3.02萬人，但有一個15人編制的醫保局在管這項工作；而5個新農合試點縣（市、區）的參合農民為132萬，參合率82％，管這項工作的市衛生局只是借了兩個人負責日常工作。
　　
縣鄉新農合經辦機構承擔了更多的具體工作，但有的試點縣還處于無常設機構、無編制、無專職人員、無專項經費的狀況。國家一再強調新農合經辦機構的人員和工作經費要列入同級財政預算予以保證，不得從合作醫療基金中提取。這幾年各地嚴格執行了這一政策，連基金產生的利息都用于參合農民。但目前的情況是管理機構無編制無專項經費。由一支沒有錢、人數少又不穩定的隊伍來管一項長期的工作，不僅影響新農合制度的建立，而且不利于加強對這項工作的組織管理和監督指導。解決各級經辦機構的設置和人員編制迫在眉睫。