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有助于檢測癌癥基因的算法 【?2006-07-17 發布?】 美迪醫訊
研究人員開發了一種算法，能提高癌癥基因的檢測能力。該算法已被應用于描繪肺癌的腫瘤抑制基因。
研究人員用基因芯片發現，當從一組癌癥病人的單份基因組或雙份基因組刪去染色體片斷時，被刪去的染色體片斷能指出癌癥所隱含的腫瘤抑制基因的位置。紐約大學Courant數學科學研究所(紐約, 紐約, 美國; www.cims.nyu.edu)的研究人員致力于自動化方法的研究，以可靠地檢測這些基因及其位置和邊界。他們開發的這種算法能采用Affymetrix(Santa Clara, CA, 美國)基因芯片的數據精確定位癌癥中所含的基因，甚至在該基因組存在其它的無關缺失時也能做到。
為了驗證他們的算法，研究人員制作了一種高保真的腫瘤硅膠模型，以考察當修改該模型的各種參數時，是否能很好地檢測出正確的基因。他們將該算法應用于病人數據，并成功發現了文獻中已知的許多基因，以及具有統計學意義的其它幾種基因。該算法可用于檢測癌癥基因，這些基因在突變或過度表達時就能促進腫瘤生長。
該研究是由紐約大學Courant研究所和醫學院(紐約, 紐約, 美國; www.med.nyu.edu)的Bud Mishra教授及其同事開展的。研究結果將在2006年7月的《美國人類遺傳雜志》上進行報道。
紐約大學研究團隊成員Salvatore Paxia博士和Thomas Anantharaman博士正在為該軟件創建一個更簡單的界面，使其兼容許多不同的芯片技術，從而走向大范圍推廣。
Courant Institute of Mathematical Sciences, NYU >> www.cims.nyu.edu
School of Medicine NYU >> www.med.nyu.edu
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有助于檢測癌癥基因的算法
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