臺灣自1995年開始全民健康保險，因為是強制保險，保險覆蓋率達99.7％。百姓希望實施全民健保，但對醫院來說，如果相關配套設施不具備的話，無異于是一種“災難”。
　　
臺灣設計全民健保的最初理念，是要為民眾買健康，提升醫療質量，與醫院建立伙伴關系。但經過12年的時間，伙伴關系幾乎變成“仇人”。盡管醫療質量提升了，但不是全民健保的功勞，而是醫院加強臨床教學與科研的結果。即使這樣，據民眾滿意度調查顯示，患者仍希望醫療服務更便捷、質量更高，期望保險支付的比例更低、醫療檢查的項目更多、用藥的限制進一步放寬、醫療機構更有同情心等。由此可以看出，百姓的醫療需求會不斷上漲，而且永遠不會有醫療成本的概念。
　　
臺灣實施全民健保后，支付制度發生了重大改變，從最初的按量計酬，發展到了現在的總額預算。按量計酬是醫院做多少，健保局就支付多少，醫院不用考慮保險成本，只要治療和檢查合理，政府就會全額支付費用。這樣的后果就是醫療費用年年上漲，直到健保局難以為繼。之后，健保局推出總額預算辦法。由衛生主管部門負責作出年衛生費用總額預算。其好處是醫療成本預算永遠不會超支。醫院得到的費用總額是固定的，提供醫療服務越多，得到的回報越少。
　　
總額預算帶來的負面效果非常明顯。患者不愿意拿更多的錢來看病，健保局支付的費用又是一定的，所以最后只能壓縮醫務人員的薪水，造成人才流失，甚至倒閉。近幾年，臺灣已有100多家醫院先后倒閉。不僅如此，臺灣的全民健保政策，還因刺激了患者更高的醫療需求，使醫療市場競爭加劇，醫院搶購高新設備和人才，加大了醫療成本，越大的醫院虧損越嚴重。
　　
不適當的成本控制、不成熟的醫院管理，必然導致醫療質量的下降及醫療糾紛的發生。臺灣全民健保制度必將被商業保險取代，而醫院要做到既降低成本，又不影響醫療質量，最好的辦法是同業合作，建立聯盟組織。