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基于微芯片的檢查可識(shí)別流感病毒株

【?2006-10-24 發(fā)布?】 美迪醫(yī)訊
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一項(xiàng)基于微芯片的檢查將使更多實(shí)驗(yàn)室能夠診斷流感,并獲悉致病病毒的情況。

該項(xiàng)新檢查在12小時(shí)之內(nèi)成功地識(shí)別了72種流感病毒株中的H5N1型禽流感病毒。新近開發(fā)的技術(shù)可用于基層生物安全機(jī)構(gòu),使更多實(shí)驗(yàn)室能夠確定新出現(xiàn)病毒的地理來源、是否來源于人類,了解新病毒與先前傳播的病毒的關(guān)系密切程度,并檢測(cè)預(yù)示病毒毒性加劇的基因變化,因此將擴(kuò)展診斷流感的能力。

FluChip是一種微陣列,常被稱為基因芯片。該芯片由科羅拉多大學(xué)波德校區(qū)(Boulder, CO, USA; www.colorado.edu)和疾病預(yù)防控制中心(CDC, Atlanta, GA, USA; www.cdc.gov)的科學(xué)家們開發(fā)。微陣列的制作是使用機(jī)器手將數(shù)以百計(jì)或千計(jì)已知序列的遺傳物質(zhì)斑(DNARNA)滴在顯微鏡載玻片上。然后將這些稱作探針的斑接觸含未知組成的樣品,比如采自患未確診疾病患者的物質(zhì)。如探針與樣品中存在的病毒基因序列匹配則捕捉到了目標(biāo)基因。通過分析被捕捉目標(biāo)的基因圖譜,醫(yī)生可以診斷感染原因。

疾病預(yù)防控制中心(CDC)向科羅拉多大學(xué)的科學(xué)家提供了流感病毒分離株,以用FluChip進(jìn)行鑒定。樣品包括感染人類、馬、鳥和豬的病毒株。CDC分享了自己在流感方面的技術(shù)專長(zhǎng)并與科羅拉多大學(xué)的人員一起在CDC實(shí)驗(yàn)室處理流感樣品、測(cè)試FluChip技術(shù)并分析結(jié)果。72%的樣品可獲得關(guān)于病毒株型和亞型的正確信息。測(cè)試并確認(rèn)病毒株需花費(fèi)11個(gè)小時(shí)。研究結(jié)果發(fā)表在2006年八月號(hào)的臨床生物學(xué)雜志上。

“這項(xiàng)前沿研究對(duì)于我們努力保障全民健康至關(guān)重要,它為我們對(duì)抗流感的工具箱提供了一件新工具。”CDC主任Julie Gerberding博士說,“這個(gè)例子很好地證明了如果政府和學(xué)術(shù)界的研究人員通力合作,我們就能取得進(jìn)步,我們期望著未來的合作。”

國(guó)家過敏及傳染性疾病研究所(NIAID, Bethesda, MD, USA) 流感項(xiàng)目組官員Karen Lacourciere博士說,用于診斷流感的改良型基因芯片的開發(fā)部分取決于是否已經(jīng)實(shí)現(xiàn)了基因組序列數(shù)據(jù)的共享。除了洛斯阿拉莫斯國(guó)家實(shí)驗(yàn)室(Los Alamos, NM, USA)CDC的流感基因組序列數(shù)據(jù)庫之外,科學(xué)家們還使用了NIAID資助的流感基因組測(cè)序項(xiàng)目的信息。

 

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