河南省食品藥品監管局大力實踐科學監管理念，不斷創新監管模式，保證了藥品質量的穩步提升，規范了藥品市場秩序，促進了醫藥經濟的健康發展。該省藥品質量合格率連續三年保持在98%以上的較高水平，全省沒有發生重大藥品安全事件。2007年全省藥品評價性抽驗合格率98.13%，全省醫藥工業實現銷售收入為2002年的3.5倍，實現利潤為2002年的8倍。
 
為保證藥品質量，河南省食品藥品監管局嚴格藥品注冊審核關，開展了醫療機構制劑整頓工作，核發醫療機構制劑文號3300個，結束了醫療機構制劑處方、工藝不固定，審批管理混亂的局面。同時，該局對全省藥品文號進行了普查和清查，保證了藥品申報資料的齊全完整，全省9740個批準文號均能追溯到源頭。為保證對藥品生產質量的有效控制，該局在全省重點開展了監督藥品生產企業實施以品種為單元的GMP管理工作，引導和監督企業真正建立起以品種為單元，以崗位為基點，完整真實地將GMP全部條款落實到每個具體品種的生產全過程，落實到每個管理崗位和生產崗位，全員全面地按照GMP組織藥品生產，切實保證藥品質量。

為規范流通秩序，該局著力整治批發企業出租（借）許可證、代開發票，零售連鎖企業藥品不統一配送、門店自行外購，零售藥店出租（借）柜臺等不規范行為；取締無證經營戶28個、掛靠經營戶72個，注銷零售連鎖企業29家，剝離連鎖門店2902個；撤銷和收回GSP證書31個，吊銷《藥品經營許可證》36個。該局還采取監測與公告、宣傳和曝光、監管與抽驗相結合的措施，深入開展違法藥品廣告整治，及時公告、曝光、查處違法藥品、醫療器械廣告和產品，對違法情節嚴重的10個品種暫停銷售，有效遏制了違法發布藥品廣告行為。此外，該局通過開展農村藥品“兩網”建設，形成了“縣級監管、鄉級協助、村級報告”的農村藥品監管網絡，所有鄉鎮建立了藥品供應網點，96.2%的行政村實現藥品供應配送進村，形成了規范有序、經濟方便的農村藥品供應網絡。
 
為提高藥品質量，該局針對當前市場上假劣藥品品種、類別、比例、分布現狀，開展了藥品抽驗機制改革，建立了農村藥品專項評價性抽驗指標體系、評價機制和藥品抽驗信息平臺，對省、市、縣三級局及其內設機構的職能進行了合理調整，形成了一個行政相對人只有一個內設機構進行日常監督抽驗的新模式，使監管資源配置更加合理，防止了重復抽驗，提高了監管效率。該局還設立藥品抽驗人員數據庫，從數據庫中隨機抽調人員組成抽驗組，由省局對市局、市局對縣局分級進行抽驗評價，并將其作為考核當地監管工作效果的重要依據，評價結果與藥品打假經費、領導班子年度考核掛鉤，促進了各級食品藥品監管部門將監管工作重心下移，增強了監管工作的效果。