預計到明年，南京市50家二級醫療機構將全部完成改革，沿襲了半個世紀的市、區、街道三級醫療網，將被醫療中心和社區衛生服務機構兩級網所替代。

南京市采取上靠、下沉、轉行等方式，對城區三級醫療機構進行改革。上靠是指鼓勵優勢醫療機構通過對二級醫療機構進行兼并、托管、連鎖經營、成立集團等形式，重組醫療資源。下沉是指推進區級醫療機構、街道衛生院向社區衛生服務中心、社區衛生服務站轉變。社區衛生服務中心原則上以二級醫院改建，社區衛生服務站原則上以街道衛生院改建。目前，全市已有社區衛生服務中心22個，社區衛生服務站188個。近一半的二級醫院和90％以上的街道衛生院已完成改建。全市二級醫療機構已轉行建成社區護理院、康復院10個。