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深圳地區(qū)艾滋病患者HIV-1毒株膜蛋白V3環(huán)的氨基酸變異分析

【?2006-01-26 發(fā)布?】 臨床報道  

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    (深圳)為了了解深圳地區(qū)艾滋病患者體內(nèi)不同HIV-1亞型膜蛋白V3環(huán)的氨基酸序列特征及變異特點。研究者采用逆轉(zhuǎn)錄套式聚合酶鏈反應(yīng)(RT-nested-PCR)對艾滋病患者血漿HIV RNA進(jìn)行擴(kuò)增,對擴(kuò)增產(chǎn)物直接測序并進(jìn)行序列對比、翻譯和分析。結(jié)果深圳地區(qū)艾滋病患者感染HIV病毒分屬B與CRF01-AE亞型,病毒V3頂端的四肽特征主要為:GPGQ 48%、GPGR 36%、其他形式16%;其中AE亞型GPGQ百分比為76.9%,B亞型GPGR百分比為75%;還發(fā)現(xiàn)DQDR、DQGQ等少見V3環(huán)頂端四肽組成形式。V3環(huán)發(fā)生與SI表型有關(guān)的氨基酸突變形式高達(dá)80%。可見深圳地區(qū)艾滋病患者感染病毒V3環(huán)頂端四肽主要為GPGQ與GPGR,V3環(huán)序列高度變異,出現(xiàn)一些少見的V3環(huán)頂端四肽組成形式值得進(jìn)一步研究。/**/
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