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廣東地區人禽流感H5N1毒株神經氨酸酶基因的特征與變異

【?2008-05-26 發布?】 臨床報道  

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    該項研究目的是通過對人禽流感H5N1毒株神經氨酸酶(NA)基因序列變異的分析,揭示毒株NA基因的變異與進化。方法采用檢測廣東GD01―06毒株NA基因核苷酸序列,同時對全球各地人禽流感H5N1毒株NA基因進行檢索,采用DNAStar 5.0軟件對檢索的人禽流感H5N1毒株NA基因核苷酸序列進行比對和分析;并結合地區資料對變異毒株進行進化速度分析。結果1997至2006年53株毒株NA基因112個氨基酸位點全部置換,占24.9%(112/450);53株毒株分為兩個系列:1997年人禽流感毒株為-個系列,2003至2006年毒株為另-系列。毒株GD-01-06與PC6231-04核苷酸序列同源性為94.1%,與1997、2004至2005年毒株比較,毒株GD-01-06發生Y081H、E363G位點置換。2003至2006年所有毒株均丟失第53位異亮氨酸,且第49位半胱氨酸置換為異亮氨酸,改變蛋白質二級結構。與同義突變比較,毒株GD-01―06的NA基因錯義突變錯義進化速率(Ka)大于同義進化速率(Ks),顯示NA基因進化受到明顯選擇性免疫壓力。得出結論1997至2006年53株毒株NA基因進化分為兩個系列;NA基因進化受到明顯選擇性免疫壓力;2003至2006年毒株C049I置換,導致蛋白質二級結構改變,其意義尚待探討。/**/
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