為了解全國醫療器械專項整治工作進展情況，2007年12月10日～20日，國家食品藥品監管局組織對天津、山東、江蘇、上海等10個省市的醫療器械專項整治工作進行了現場督導檢查。檢查結果表明：各地食品藥品監管部門對專項整治工作高度重視，工作安排細致，治理扎實認真，較好地完成了整治任務。專項整治收到了預期效果，即企業的法制意識、質量意識不斷增強，醫療器械市場進一步凈化和規范，監管部門的監管能力也得到了提高。 
 
2006年6月全國醫療器械專項整治工作會議召開后，各地對轄區醫療器械專項整治工作進行了動員部署，成立領導小組，制訂實施方案，落實各項工作任務，并對檢查范圍和內容、檢查重點、檢查時間及組織實施、工作要求、檢查紀律等進行了明確規定和全面部署。國家局結合各地醫療器械生產企業的具體情況，制訂了醫療器械生產企業專項整治檢查的計劃，細化了醫療器械生產企業專項整治檢查表，明確了專項整治檢查結果處理判定原則，統一細化了檢查內容，對檢查人員進行了專項動員、培訓，使檢查工作保持一個尺度。在此期間，各市、縣食品藥品監管部門按其監管范圍，對轄區內所有醫療器械生產、經營企業進行全面檢查。

據統計，專項整治以來，全國核查企業總次數達19817家次，國家重點監管企業檢查1310次，省重點監管企業檢查1719次，有的企業檢查超過兩次以上，檢查的比例在100%以上。突擊檢查企業7070次，重點品種專項檢查2918次。通過檢查立案并處理完畢企業數412家，自愿退出企業數413家，限期整改企業2240家，停產整改企業227家，注銷醫療器械生產企業許可證1016家，撤銷醫療器械生產企業許可證15家。接到投訴舉報439起，對其中431起進行了處理。通過本次核查也掌握了我國醫療器械企業的總體和分布情況，摸清了家底。截止到2007年11 月30日，我國有醫療器械生產企業12449家，其中Ⅰ類醫療器械生產企業3221家，Ⅱ類醫療器械生產企業7157 家，Ⅲ類醫療器械生產企業2120家。國家重點監管企業750家，省重點監管企業1030家。2007年度新增企業9 61家，變更生產企業1289家。

又訊在統一核查標準、制訂核查程序、明確核查紀律的前提下，2007年，國家食品藥品監管局按照整頓和規范藥品市場秩序工作文件要求，組織開展了全國醫療器械注冊資料核查工作，對所有在有效期內醫療器械注冊證進行了核查。通過核查摸清了醫療器械注冊中存在的問題，并對發現的問題100%進行了處理，有力地遏制了醫療器械注冊申報中的弄虛作假行為，規范了醫療器械的注冊行為。

為按時完成整治工作，國家局根據各個省(區、市)醫療器械生產企業數量、分布情況及監管資源情況，制訂了醫療器械生產企業專項整治檢查計劃、檢查結果處理判定原則，統一了醫療器械注冊資料核查標準，并對10個省的Ⅰ類和Ⅱ 類醫療器械注冊資料核查工作進行了監督檢查，及時解決各地在核查中發現的問題。

國家局共派遣核查組26個，核查人員97人次，承擔了境內已獲注冊證和在審的心臟起搏器、心臟瓣膜、血管支架和人工關節等高風險品種的核查工作，涉及15個省(區、市)的86家生產企業的151個產品，并組織相關省(市、區)局對1400多個在審Ⅲ類產品的醫療器械申報資料進行了真實性核查。真實性核查內容涉及注冊申報資料中的產品標準、檢驗報告、臨床試驗資料、說明書、企業資格證明文件等方面，重點核查了注冊申報資料中臨床試驗資料的真實性，并結合生產質量體系證明文件核查了檢測樣品的真實性。

核查發現，企業臨床資料真實性方面存在的問題較多。核查組將發現問題的產品分為涉嫌虛假、嚴重不規范和一般不規范三類，并針對不同的情況提出了相應的處理意見，其中涉嫌虛假的產品已全部申請注銷注冊證和撤回注冊申請資料；對于嚴重不規范的在審品種，予以退審；對于嚴重不規范的已經取得注冊證的產品，要求企業停產整改。

整改后經審查合格的企業方可恢復生產，未能按要求提交報告或經審查不合格的按有關規定處理。對于存在一般性不規范問題的產品，由國家局發文，責成企業所在地省級食品藥品監管部門負責督促整改、加強監管。

據統計，此次全國共核查Ⅰ類醫療器械產品注冊證書12118個，Ⅱ類醫療器械產品注冊證書17354個。對所有在有效期內醫療器械注冊證進行了核查，核查的比例達到了100%。通過核查，有760個注冊產品需要補充完善技術資料，2007個產品需要補充檢驗項目，有188個產品不屬于醫療器械管理，275個產品高類低批，782個產品使用說明書存在違規問題，還有48個產品存在作用機理不明確的問題。通過核查注銷注冊證924個，撤銷注冊證61個。