2004年福建省將進一步深化公共衛生體制改革，疾病信息網絡體系、疾病預防控制和衛生監督體系、突發公共衛生事件醫療救治體系的建設是重中之重。

福建省將建立疾病信息網絡，實現省、市、縣、鄉四級聯網，進一步加強疫情報告制度管理，加強疾病預防控制和醫療機構的合作，一旦發生疫情，能做到“早發現、早報告、早隔離、早治療”。

2004年內，各設區市和省會城市必須在現有“120”急救中心的基礎上改擴建為緊急救援中心；各設區市必須按每人1張病床的標準新建或改建一所傳染病醫院或后備醫院；每個縣必須在一個綜合性醫院內建立傳染病區。

2004年底前，各市、縣要完成衛生監督和疾病預防控制機構的組建工作。目前，省級和廈門市的疾病預防控制和衛生監督機構已組建。