建立新型農村合作醫療制度，是切實解決新形勢下農業、農村、農民問題，促進整個社會和諧發展的重大舉措。最近，福建省新型農村合作醫療技術指導組有關專家在接受采訪時指出，順利推進新型農村合作醫療要努力解決好四大矛盾：

新型農村合作醫療開展的復雜性與試點工作經驗不足的矛盾
                        
福建醫科大學社會醫學與衛生事業管理學院教授鄭振佺教授認為，開展農村合作醫療是一項涉及整個農村社會的系統工程，需要進行多方面的研究探索。農村合作醫療涉及的農民數量多，健康狀況、經濟狀況、文化程度以及對醫保制度的認識等各個方面都大不相同；各個地區在醫療衛生服務能力、農民經濟承受能力、政府財政支持承受能力上也有明顯差異；目前試點地區暴露出來的管理人員素質偏低、經驗不夠、資源有限等問題沒有得到足夠重視。鄭教授認為：“如果對開展新型農村合作醫療的復雜性缺乏足夠認識，這一制度的全面推廣仍將處處掣肘。”

合作醫療資金政府補助的必要與各級政府財政難以確保的矛盾

新型農村合作醫療要求各級政府財政給予一定的補助，但是農民數量巨大，地方籌資困難重重。鄭教授舉例：福建省農業人口２０００多萬，按現在計劃每人每年平均１０元計算，省級財政每年要支出２億多元，各縣市農業人口多的近百萬，少的也有十幾萬，其財政支持的總數相當大，但目前許多縣、市僅處于維持“吃飯”的財政狀態，在試點工作過程中，各級政府尚能盡力劃撥一定數量給予補助，但缺乏強有力的法律政策保證，各有關人員都擔心全面鋪開之后各級政府能否每年劃撥足夠的補助資金，并隨著社會經濟的發展而逐步增加。

農村合作醫療資金總額不足與現階段高額醫療費用的矛盾

據福建省新型農村合作醫療技術指導組組長潘寶駿教授介紹，目前該省開展農村合作醫療的試點縣（區），多的合作醫療資金為每人４０元，少的每人３０元。而根據各地的基線調查結果，農民在各級醫療機構的醫療費用每次門診要幾十元；每次住院至少要幾百元，多的達萬元以上。用較少的合作醫療基金來補償如此高的醫療費用，必然產生補償收益面與補償比例的矛盾。所以，在試點縣區的補償方案中可明顯看出，報銷比例較低，農民參保后自付的醫療費用還很高。農民感覺參加合作醫療雖然能得到一定程度的補償，但難以解決因病致貧、返貧的問題。

農村合作醫療參保率與農民自愿參加的矛盾

我國政府積極倡導新型農村合作醫療保障制度，并給予較高比例的資金補助，但由于大多數農民對新型農村合作醫療缺乏感性認識，同時，較低的受益面和較低的補償比例也使很多人覺得參加合作醫療的意義不大。再加上農村長期以來某些不當工作方式造成的干群關系緊張，許多農民對參加新型合作醫療的積極性不是很高。潘教授認為，如果不采取有效的宣傳動員措施并建立長期制度，就會造成參保率偏低，農村合作醫療的補償測算就增加了不確定性，補償制度持續性的風險也不容易規避。