2009年3～7月，云南省食品藥品監督管理局在全省范圍內開展了以強化企業痕跡管理和過程控制為核心的醫療器械專項監督檢查，經過各州、市食品藥品監督管理局和省局稽查局的共同努力，專項檢查工作取得明顯成效。

全省各單位緊緊圍繞省局確定的工作目標、檢查范圍、檢查重點、檢查方法，對轄區內所有二、三類醫療器械生產企業；所有醫療器械專營企業、家庭常用器械及體驗式經營企業；部分醫藥公司兼營醫療器械企業和藥品零售門店兼營二、三類醫療器械企業依法進行檢查，并將此次專項檢查與日常監管相結合，與全國計劃生育藥械市場專項整治工作相結合，與國家食品藥品監督管理局進口避孕套及體外診斷試劑抽驗工作相結合，與2009年省級醫療器械質量監督抽驗和靶向抽驗工作相結合，與誠信建設相結合，統籌兼顧，整體推進。

截止到2009年7月底，全省共出動監管人員11335人次，檢查生產企業81家，通過檢查要求企業限期整改14家。檢查經營企業5248家，通過檢查要求企業限期進行整改274家，立案130件，行政處罰123件，擬上報省局公告注銷經營企業61家。

通過專項檢查，進一步強化了云南省醫療器械生產、經營企業對生產原材料、半成品及醫療器械產品進貨、存貯、銷售三個環節物流管理的可追溯性，完善退出機制，提高企業質量管理水平，增強產品質量第一責任人意識，有效保障監管工作及時、準確、到位。