2005年1月1日起，泉州市藥品、醫療器械經營企業的許可證發放、變更、換證，以及藥品經營企業的籌建許可、gsp認證等行政許可的申請、受理、審批等工作，將應用國家食品藥品監督管理局統一制作的“藥品醫療器械經營許可證管理系統”。

據悉，此舉將規范藥品、醫療器械經營企業行政許可審批工作，方便申請人采取數據電文等方式提出行政許可申請，及時有效地進行數據交換，并公開有關行政許可的實施和結果。

截至2004年12月31日，泉州市已有藥品批發、零售連鎖企業27家（比增12.5％）；藥品零售企業859家（比增21.3％）；醫療器械生產企業28家（比增175％）；醫療器械經營企業408家（比增12.6％）。同時，建成全省首家醫藥物流中心，并初步實現了農村藥品供應網絡的對接，保證了廣大農民的用藥安全有效。