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用激光捕獲顯微切割聯合蛋白質芯片篩選肺腺癌和鱗癌組織差異蛋白研究 【?2007-09-08 發布?】 臨床報道
西安交通大學醫學院第二附屬醫院 浙江大學醫學院第二醫院腫瘤研究所 余捷凱 鄭 樹 肺鱗癌和腺癌是肺癌的主要組織類型;應用蛋白質組學方法比對兩種腫瘤的差異蛋白是闡明其癌變機制、篩選分型和診斷標志的有效手段。但腫瘤組織的異質性是蛋白組學研究面臨的主要問題。激光捕獲顯微切割(LCM)技術是解決腫瘤組織異質性問題的有效方法。其聯合表面增強激光解吸離子化飛行時間質譜(SELDI-TOF-MS)蛋白質芯片技術可以從微量樣品中篩選差異蛋白。 我們應用LCM聯合SELDI-TOF-MS 蛋白質芯片技術及支持向量機(SVM)方法進行肺腺癌和鱗癌差異蛋白組研究的可行性。將6 例新鮮肺腺癌及7 例肺鱗癌組織標本制備8um 厚度冰凍切片;改良HE 染色;用LCM選擇性獲取1.2×105/個同質腺癌細胞和1.45×105/個鱗癌細胞。經過PBS II+型SELDI-TOF-MS 分析儀(IMAC 芯片)分析腺癌及鱗癌細胞的蛋白質表達譜并對比差異點;應用ZUCI-ProteinChip DataAnalyze System 軟件包篩選并驗證候選的標志蛋白的判別效能。 結果表明在比較鱗癌和腺癌細胞間的SELDI 譜圖,共篩選出87 個差異蛋白峰。將差異最明顯的10 個蛋白峰作為潛在的候選標志蛋白。4種蛋白(分子量分別為2505 U、4004 U、4847 U、11412 U)在鱗癌中呈高表達;6 種蛋白(分子量分別為3333 U、3592 U、3848 U、5036 U、5191 U、5211 U)在鱗癌中低表達而在腺癌中呈高表達。其中4847 U 在鱗癌和腺癌中表達比較差異有統計學意義(P<0.05)。隨機組合10 個差異蛋白,形成組合模型;用SVM 和ROC 曲線建立分類預測模型并評價各模型效能;篩選出由3 個蛋白質點(分子量分別為4847 U、11412 U、3592 U)組合成的分型診斷模型。經盲法交叉驗證該模型可以準確區分鱗癌和腺癌,其敏感度和特異度可達100%。提示LCM 聯合SELDI 蛋白質芯片技術可以篩選敏感性高、特異性強的肺癌標志蛋白及分型診斷模型;該技術將為肺腺癌早期診斷研究提供新的有效工具。
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