乙肝病毒感染后發生慢性化的機理很復雜，變成慢性患者（包括慢性乙肝病毒攜帶者與慢性乙肝）的治療難度也因此更大。綜合10多年來國內外在這方面臨床研究資料可見，至今還沒有一種藥物或一種療法可以把大多數慢性病例治愈，或應用后取得長期抑制病毒的療效。慢性病例治療上這種現狀，促使不少學者研究慢性病例的治療策略。在這方面國外有些學者在2001年以來提出過不少聯合療法的新策略，抗乙肝病毒特異性主動免疫療法加上核苷類似物抗病毒藥聯合療法，是其中比較好的新治療策略。

這種新的治療策略的原理是，利用核苷類似物抗病毒藥抑制乙肝病毒復制的作用，迅速降低血內乙肝病毒量，很快地改善患者體內具有抗乙肝病毒作用的特異性免疫淋巴細胞的功能。在這個基礎上，再用抗乙肝病毒特異性主動免疫療法修復與重建患者特異性抗病毒免疫，并通過這種抗病毒免疫更持久地抑制乙肝病毒復制，甚至將病毒從肝內清除掉，結束患者的持續病毒感染狀態。2003年10月28日在美國波士頓曾召開全美肝病研究協會第54次年會，在會上曾有學者報告，在上述原理基礎上，用抗乙肝病毒特異性主動免疫療法加核苷類似物抗病毒藥聯合療法治療慢性乙肝，結果取得了令人鼓舞的效果，其乙肝病毒DNA與c抗原陰轉率分別達到100％與55％。另外一些臨床研究結果提示，抗乙肝病毒特異性主動免疫療法與核苷類似物抗病毒藥聯合療法可縮短核苷類似物抗病毒藥的療程，從而減少核苷類似物抗病毒藥長療程使用帶來的病毒變異，同時又減少了核苷類似物抗病毒藥停藥后的復發率。

不少學者指出，上述聯合療法新策略之所以能提高治療慢性病例的療效，是由于在治療學上處理好抗病毒治療中兩個重要環節，即用外來藥物直接抑制病毒，同時通過修復與重建抗乙肝病毒特異性免疫，調節機體自身的抗病毒能力。兩者起協同作用。