衛生部新聞發言人毛群安10日說，目前，災區大規模緊急醫療救援工作基本結束，衛生防疫和監督各項工作全面展開。迄今災區未發生重大傳染病疫情和突發公共衛生事件，但大災后防大疫的任務仍然艱巨。
 
毛群安說：“這次災情嚴重，災區面積大、交通不便，這些特點對防疫工作來說是一個障礙；再加上堰塞湖的威脅，一旦潰壩，大面積過水也將對防疫形成挑戰，發生傳染病的風險依然很高。”此外，災民的集中安置也加大了傳染病傳播的風險。
 
針對當前工作中的具體困難和薄弱環節，衛生部不斷完善應急預案：一是在堅持衛生防疫工作全覆蓋基礎上，加大對環境衛生的綜合整治力度，發動群眾開展愛國衛生運動，推行垃圾、糞便無害化處理示范點建設。
 
二是進一步加強傳染病疫情監測與報告的及時性、敏感性和準確性，做好對聚集性病例的核實與追蹤，在災區實行疫情日報告和零報告制度。    三是做好重點人群做好甲肝、乙腦等疾病的預防接種工作，建立人群免疫屏障，預防重點傳染病發生流行。
 
四是保障災區群眾的食品和飲用水衛生安全。衛生監督人員實行分區劃片、定崗定員、巡回指民，重點對災民臨時集中安置點的集中供水供餐以及分散式供水的衛生監督工作，保障災區群眾的食品和飲用水衛生安全，有效預防食物中毒、腸道傳染病、食源性疾病發生。
 
毛群安介紹，截至目前，衛生部共向四川災區派出醫療、防疫、監督人員1萬余名，緊急從全國各地抽調急救車、防疫車和衛生監督車將近2000輛，重災區的衛生防疫工作員、消殺物資、疫情監測已實現全面覆蓋；組織制定了《抗震救災衛生防疫工作方案》《鼠疫等3種傳染病疫情應急處理預案》《抗震救災衛生監督工作指南》《關于加強地震災區飲用水安全工作的緊急通知》等一系列工作預案和方案。