公立醫院改革是一項系統工程，涉及面廣，難度很大，其中理順管理體制至關重要。管理體制不順，政府投入再多，只能是加劇重復建設，惡性競爭，資源浪費，效率低下。

由于部門利益，理順管理體制恐怕是最難的。以武漢市為例，至2007年，全市各類醫療機構共5735家，其中綜合醫院157家，專科醫院34家，中醫及中西醫結合醫院43家，衛生院及分院103家，社區衛生服務中心96家，政府主辦的公立醫院52家。按隸屬關系分，俗稱“八路軍”，即部屬、省屬、市屬、區屬、鄉鎮、部隊、企業、民營等，隸屬關系不同，管理體制不同，投資渠道不同，沒有統一的權威的有效的監管機制。各類醫療機構為了生存與發展，在競爭中各顯其能，各行其是，規模競相擴張，設備競相購買，專科競相建設，人才競相引進，形成城區內惡性競爭，農村里資源短缺，大醫院越做越強，基層機構漸漸萎縮的局面。

如果這種局面不改變，深層次問題不解決，公立醫院改革談何容易。第一，管理體制不同。如果加大政府投入，不同級政府，投向不同，豈不加劇重復建設。第二，管理體制不同。地域衛生規劃不能實現，政府應該補貼扶持的，不知道補貼扶持誰好，衛生資源難以合理有效配置，新開發的居民區、農村偏遠地區，依然短缺。第三，管理體制不整合。不同管理體制的醫療機構各行其是，公立醫院公益職能無法體現，政府監管難以落實，居民醫療服務體系難以完善。

要改變這種局面，各級政府必須痛下決心，割舍部門利益，實行屬地管理，按照區域衛生規劃整合現有資源，大力推進黨的十七大提出的“政事分開、管辦分開、醫藥分開、營利性和非營利性分開”，最終建立起“覆蓋城鄉居民的公共衛生服務體系、醫療服務體系、醫療保障體系、藥品供應保障體系”。理順管理體制這一坎不邁，公立醫院改革難。