2004年7月6日，國家食品藥品監管局發布《關于貫徹落實<國務院對確需保留的行政審批項目設定行政許可的決定>的通知》（國食藥監法[2004]328號），為保證國務院決定設定的行政許可依法、公開、公平、公正實施，就有關貫徹落實問題通知如下：

盡快對國務院決定保留的行政許可項目的條件等內容作出具體規定。國家食品藥品監督管理局有關司室要盡快擬訂部門規章對實施國務院決定所列涉及食品藥品監管的12項行政許可的實施機關、條件、程序、期限等內容作出具體規定，并予以公布。對于國務院決定中實施主體為國家食品藥品監管局和省級人民政府食品藥品監管部門的三項許可，要特別注意明確國家局和省級局的權限劃分。有關實施行政許可的程序和期限要嚴格按照《行政許可法》的有關規定執行。

繼續推動對國務院決定保留的行政許可項目的立法工作，不斷完善食品藥品監管法規體系。對于國務院通過發布決定的方式設定的行政許可事項，各單位在實施過程中要嚴格依照《行政許可法》的有關規定執行，加強調查研究，推動相關的立法工作，及時提請制定法律法規。

強化對行政許可的監督檢查，認真開展系統內執法檢查工作。為確保《行政許可法》的各項規定落到實處，國家食品藥品監管局將對各單位、各部門實施行政許可進行檢查，重點檢查違法設定行政許可，搞地方保護、行業壟斷，該許可的不許可、不該許可的亂許可，許可后不依法履行監督職責的問題。對造成嚴重后果的違法行為，一經發現就要堅決糾正，并依法處理有關責任人和行政領導。

嚴格貫徹實施《行政許可法》，提高依法行政能力。實施行政許可必須嚴格依法進行，加強制約和監督，確保有關行政許可真正發揮作用。繼續深化行政審批制度改革，對不需要行政許可但需要監管的事項，要強化間接管理和事后監督，充分發揮行政規劃、行政指導、行政合同的作用。各部門、各單位要進一步強化服務觀念，改進工作作風，做到公開透明、高效便民，提高依法行政能力，樹立食品藥品監管部門公正、權威的執法形象。