經過兩個月的集中教育，國家食品藥品監督管理局各單位、各部門深入分析監管工作存在的問題和教訓。在“突出監管重點、解決監管熱點、攻破監管難點”上拓展整改思路，針對食品藥品監管過程中的行政執法、技術支撐等各個環節，堅持科學發展觀，樹立和實踐科學監管理念，下大力氣研究整頓作風、整改監管、重塑形象的措施，提出了整改新舉措。

強化藥品市場監督，規范和整治藥品市場秩序。健全藥品市場監督法規體系，制定《醫療器械流通監督管理辦法》、修訂《醫療器械廣告審查辦法》、《藥品經營質量管理規范》。藥品市場監督工作納入信息化管理。加大對疫苗、血液制品、注射劑的質量考核。規范藥品抽驗工作程序，加大藥品醫療器械抽驗力度；開展藥品經營企業分級、分類管理試點工作，促進藥品批發企業整合，減少流通環節；嚴厲打擊違法廣告，建立違法廣告“黑名單”制度；建立藥品、醫療器械信用體系和信用體系獎懲機制；深入推進農村藥品監督網和供應網建設，保證農村、農民用藥安全；加大藥品經營企業GSP認證后的監督檢查工作力度，推動藥品流通秩序的進一步好轉。

完善審評機制，把好藥品審評技術關。國家藥品審評中心在整改措施中強化審評決策程序，修訂了《藥品技術審評工作程序》、《專業審評會議管理規范》、《綜合審評會議管理規范》、《審評計劃管理規范》，增強了集體決策程序和對對主審人的約束力。將崗位責任與審評流程嵌合，加強責任追究。增加“短期審評計劃”，保證“按序審評”。擴大公示所有審評及管理崗位人員，進一步加大審評公開和透明的力度。將審評開放日制度化，接受社會監督。修訂《審評意見撰寫規范》，努力統一審評尺度，防止主觀臆斷，確保審評科學公正。

健全中藥保護品種審評機制，促進中藥產業健康發展。做好《中藥品種保護條例》修訂，制定《國家中藥保護品種審理規程》和《保健食品技術審評規程》，健全中藥品種保護審評審批法規體系。從嚴格技術審評入手，加強對保健食品申報資料真實性的審查。調整國家中藥品種保護審評委員會辦公室內部機構和崗位職責，建立相互補充、相互制約的中藥保護品種和保健食品審評機制，實現醫學、藥學、監督管理分段式審評。制訂保健食品原（輔）料、保健食品新功能等管理規定，細化審評標準。

規范藥品認證管理，提高藥品認證技術支撐的質量和水平。在實施與藥品研制、生產、流通和使用有關的認證、認定的現場檢查、跟蹤檢查和監督檢查工作中，國家藥品認證中心完善認證程序和技術標準，強化全程管理，嚴格執行現場檢查與批準的藥品處方和生產工藝相結合、與品種和劑型相結合、與生產管理活動和質量管理活動相結合的檢查要求；進一步強化風險管理，對化學藥品注射劑、中藥注射劑、血液制品、重組產品、疫苗菌苗等風險劑型進行重點監管，保證藥品認證的科學性、針對性和有效性。建立藥品認證受理、檢查、審批“三分離”機制；建立認證檢查員責任追究制，公示檢查員名單；建立《認證疑難技術問題會審制度》，避免認證結論審核的隨意性，保證藥品認證的公開、公平和公正。按照專業和藥品分類分級分類配備，建立專業藥品認證隊伍。

履行綜合監督的職能，推動食品安全監管事業全面發展。發揮國家局在食品安全管理綜合協調職能，推進食品安全專項整治。建立健全食品安全責任制，推動食品安全地方政府負總責的全面落實；推進農村食品安全流通網、監管責任網和群眾監督網的建設，加大種植養殖、生產加工、市場流通、餐飲消費各環節的整治。逐步使食品安全監管工作全部納入綜合評價的績效考核中。建立食品安全信息監測網絡、食品安全動態信息數據庫和食品安全信息評估和預警指標體系，做到早發現、早預防、早整治、早解決。加快食品安全信用體系建設，使企業真正成為食品安全的第一責任人。