(上海)為了測(cè)定2003年蘇北地區(qū)無(wú)菌性腦膜炎爆發(fā)的病毒分離株部分基因序列,了解該流行株的分子生物學(xué)特點(diǎn)及遺傳變異規(guī)律,研究者隨機(jī)選取3株分離的病毒株,用能特異性擴(kuò)增腸道病毒VP1區(qū)3'段序列的兩對(duì)引物012/011、040/011進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng),擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)凝膠純化后測(cè)序。將序列輸入GenBank用BLAST程序進(jìn)行核苷酸和氨基酸序列比對(duì);選取部分腸道病毒序列,經(jīng)CLUSTALX1.83對(duì)齊后,在PHYLIP 3.5c中構(gòu)建進(jìn)化樹,了解分離毒株Echo30的進(jìn)化關(guān)系。結(jié)果 3株病毒測(cè)序結(jié)果均為Echo30型腸道病毒。進(jìn)化樹分析顯示分離的Echo30毒株與國(guó)外1999年和2000年分離株的親緣關(guān)系最近;但3株分離株自成一簇,與國(guó)外毒株存在地區(qū)差別。可見利用VP1區(qū)3'段序列可以快速正確區(qū)分腸道病毒分離株的型別,分離株與國(guó)外同型流行株在比較區(qū)段的遺傳變異規(guī)律類似。/**/